九月份，氣溫漸涼，早晚溫差增大。大部分果樹已于7、8月結束了放梢，那么后期的管理就是促進秋梢的轉綠、老熟，和提升果實品質。
肥水管理要點
1、重施壯梢壯果肥
秋梢作為重要的結果母枝，是秋季管理的重中之重。在秋梢生長中后期，果實迅速膨大，花芽也開始分化，果樹對營養的需求增大。
施肥壯梢壯果為關鍵，此時主要以腐熟有機肥、磷鉀肥為主，適量施用氮肥，結合噴施葉面肥，促進秋梢轉綠。
2、水分管理
果實膨大期對果實品質的形成很重要，此時的土壤水分對果實品質的影響很大，土壤含水量高會促進營養生長，對果實品質及花芽形成產生不利影響。為了提高果汁糖分，土壤可以相對干燥些。
秋季修剪整形
1、摘心短截
秋梢自剪后，對于較長的枝條應該摘心截短，控制秋梢的數量和質量。對未及時停止生長的枝梢進行摘心強迫其停止生長，增加樹體養分回流，可以恢復樹勢、促進花芽分化和增強樹體的抗寒性。
2、幼樹整形
9月下旬，趁枝條的柔韌性好，不容易斷裂，對幼樹進行拉枝整形，有利于樹冠的盡早形成。
3、結果樹撐枝
對于掛果多的果樹，要提前做好撐果準備工作。可以用竹叉或樹叉撐枝，減少掛果枝的壓力，防止枝條壓彎斷裂和防止風害。
結果樹管理重點
此時柑橘樹上掛的果子都是種柑人的心頭肉，一個個都十足的金貴，傷不得，掉不得，稍有不慎都可能造成致命的損失。以下幾種對果實造成的傷害一定要警惕！
1、防日灼果
9月大部分地區高溫天氣還在繼續，再加上果實膨大快，接觸陽光面積增大，果實日灼病發生嚴重，特別直立的茂谷柑和修剪不合理平面結果的樹受害嚴重。連續多日高溫時應及時補水抗旱，還可適當留些晚夏梢遮陰，或者涂白進行防曬。
2、防裂果
果實進入快速膨大期后，果皮開始變薄，再加上外界因素的影響，如暴澇暴旱，再加上營養元素不均衡，極易發生裂果。在補充鈣、鉀元素的同時，還應加強水分的管理。
3、防落果
大量的秋梢抽發，與果實爭奪養分，導致一些一些低枝，弱枝，弱樹出現黃蒂落果的現象。高發的橘小實蠅和蝽蟓等害蟲的危害會加劇落果的發生。
病蟲害防治重點
主要的病害有：潰瘍病、瘡痂病、脂點黃斑病、疫菌褐腐病
潰瘍病
潰瘍病在高溫高濕的情況下高發，防治潰瘍病以銅制劑為主，其它殺細菌為輔。
瘡痂病
瘡痂病因癥狀與潰瘍病相似而極易混淆，注意區分，主要藥劑有代森錳鋅、甲基硫菌靈、腈菌唑、咪鮮胺、唑醚菌酯等。
疫菌褐腐病
可危害嫩梢和果實，使果實腐爛發霉，并有刺激性的氣味，防治藥劑有甲霜錳鋅、甲硫吡唑脂、苯醚甲環唑。嘧菌酯、異菌脲等。
主要蟲害
主要的蟲害有：潛葉蛾、蝽類、橘小實蠅、象甲、鳳蝶尺蠖、銹壁虱、紅蜘蛛、薊馬、線蟲等
紅蜘蛛
九月是紅蜘蛛的又一高峰期，此時各種蟲態混發，世代重疊嚴重，選擇藥劑時要兼顧殺滅卵、幼螨、若螨、成螨。藥劑推薦聯苯肼酯、唑螨酯等。
潛葉蛾
主要危害嫩梢，在葉片上產生的傷口會加重潰瘍病的發生。在秋梢大量萌發和嫩芽長至1厘米左右時，應立即噴藥保護，藥劑可選用氯氟·噻蟲嗪、氯氟·噻蟲胺、1%甲維鹽阿維等。
薊馬
薊馬發生也較為嚴重，危害秋梢造成嫩葉卷縮畸形，要堅持一趟梢施藥2-3次。推薦藥劑乙基多殺菌素、毒死蜱、啶蟲脒等。
銹壁虱
銹壁虱主要是造成黑皮果，果實品質受到嚴重影響，有效藥劑有：丁硫克百威、阿維菌素等。
橘小實蠅
橘小實蠅危害的高峰期，可造成果實腐爛和嚴重的落果。防治主要以誘殺成蟲為主。