生物肥是順應世界環境保護的政策的一種生物肥料，也就是大家習慣叫的菌肥。狹義上講是通過微生物生命活動，使農作物得到特定的肥料效應的制品，也被稱之為接種劑。廣義上講是既含有作為所需營養元素，又含微生物的制品。
確切的講生物肥料是菌而不是肥，因為它本身并不含有植物生長發育需要的營養元素，而只是含有大量的微生物，在土壤中通過微生物的生命活動，改善作物的營養條件。化肥和農藥的大量應用對于人類而言利弊并存，為興利除弊，科學家提出了“生態農業”，逐步實現在農田里少使用或不使用化肥和化學殺蟲劑，而使用有機生物肥料和采用微生物方法防治病蟲害。
其中生物肥主要可分為生物有機肥、秸稈腐熟劑和畜禽糞便、有機垃圾發酵劑、微生物接種劑、光合細菌肥料、復合微生物肥料、“酵素菌”和“EM ” 這幾類。生物有機肥是農業和畜牧業的廢棄物或有機垃圾經有益微生物發酵、加工而成的有機肥料稱為生物有機肥料。秸稈腐熟劑和畜禽糞便、有機垃圾發酵劑是農畜業廢棄物和生活垃圾采用微生物發酵方法處理固體有機廢棄物而生產的生物肥。 微生物接種劑是微生物接種劑是指用已知的有益微生物經液體發酵生產而成的液體活菌制品，或菌液經無菌載體吸附而成的固體活菌制品。光合細菌肥料主要用于畜禽飼養和水產養殖，也可以用于農作物拌種和葉面噴施。復合微生物肥料的產品形式主要有三種。種是微生物接種劑與有機物料、無機肥料混合后造粒；第二種是微生物接種劑與有機肥料混合造粒然后與化肥復合肥混合包裝；第三種是在有機無機復合肥的包裝中附加一袋微生物接種劑，在田間施用前，將接種劑與有機無機復合肥混合。“酵素菌”和“EM ” “酵素菌”和“EM ”均是從日本引進的微生物發酵劑產品。
生物肥不能直接提供作物吸收的營養物質（包括氮、磷、鉀和多種礦質元素），而是通過大量活的微生物在土壤中的積極活動來制造和協助作物吸收營養物質或產生生長激素來刺激作物的生長，這與化肥作用方式在本質上是不同的。并且生物肥所能提供的肥效不能滿足作物生長對營養物質的需求。生物肥是不能完全代替化肥的。在農業生產中生物肥料的使用與化肥的使用應當相輔相成。但生物肥沒有環境污染，有利于保護生態環境，而且生物肥料的有些作用和生態效益是化肥所不具備或不可替代的。
生物肥料生產成本低，應用效果好，不污染環境，施用后不僅增產，而且能改善農產品品質和減少化肥用量，在中國可持續發展農業中占有重要的地位。現在人們對農產品的質量要求越來越高，對生物肥的發展無疑是個助推劑。并且國家倡導的開發綠色食品，因此迫切需要生物肥料。而且從發展持續農業、有機農業、生態農業的角度來看，生物肥料的應用前景廣闊，擁有巨大的潛在市場。中國在生物肥料發展形勢下加大了研究力度。相信隨著科學的進步，研究和生產發展的需要及監督制度的完善，生物肥料一定能健康有序地發展，為農業增收發揮其應有的作用，前景將是非常廣闊的。
生物肥的無公害、無污染，配方科學、養分齊全，活化土壤、增加肥效，低成本、高產出，能有效提高耕地肥力、改善土壤環境，抑制土傳病這些優點相信定會得到快速的發展并開出一片非常好的市場。