生物肥是指不同功能微生物生命活動及其產物導致農作物得到特定肥料效應的微生物活體制品，具有生產成本低、效果好、不污染環境，施用后不僅增產，而且能提高農產品品質和減少化肥用量，在農業可持續發展中占有重要地位。
我國微生物肥這幾年可以說是蓬勃發展。主要體現在：1.產業體系形成，農業部登記的產品種類有11個，1400多個證。全國目前約有800多家微生物肥料企業，年產量超過500萬噸。2.微生物肥料菌種種類不斷擴大，所用菌種已不限于根瘤菌，目前使用菌種達到80多種。3.微生物肥料的應用效果在增產、改質、減少化肥用量、防病等方面逐漸被農民認識，應用面積不斷擴大。4.質檢標準體系基本形成。農業部將微生物肥料納入國家檢驗登記管理范疇，對微生物肥料的生產、銷售、應用、宣傳等方面進行監管。5.少數產品開始進入國際市場。
微生物肥料的主要種類有多種分類方法。按其產品類型劃分：農用微生物菌劑、生物有機肥、復合微生物肥料。按微生物種類劃分：根瘤菌、固氮菌、芽孢桿菌、光合細菌、纖維素分解菌、乳酸菌、酵母菌、放線菌和真菌等，其中以根瘤菌、芽孢桿菌類的研究深入、應用廣泛。當前我國生產上使用的菌種主要為根瘤菌、固氮菌、解磷菌、解鉀菌、放線菌及生防促生菌等。按產品劑型劃分：液體、粉體、顆粒。
其發展趨勢有以下三點：1.由單一菌種向復合菌種轉化。一般都是復合兩到五種菌，有的說用了100多種菌，那可能是在糊弄人。2.由單純生物菌劑向復合生物肥轉化。因為缺乏了養分，農民不愿意接受，為了市場的需求必須這樣做。3.由單一劑型品種向多元化轉化。比如，根據不同情況需要與摻混肥、配方肥配合使用的，還有需要機播的等等，為了適應不同的施用方法，需要多元化的劑型。
生物肥料各有各的作用，不同的肥有不同的作用。比如說有降解污染的、分解農藥殘留的、秸稈腐熟的、抗病防蟲的、促生的等等。它的功能作用歸納起來主要是兩個方面：一是提高化肥養分有效利用率；二是抗旱能力的提高和增強植物的抗病蟲能力；三是促進生長，主要目的是改良土壤。