椒類黑霉病主要危害果實，發病初期在果實上產生淡褐色不規則凹陷斑，一個果實上多產生一個大病斑，上生黑色霉層。黑霉病多侵染日灼果、臍腐病果以及過度成熟的果實。
彩椒果實較大，很多病斑是由初期的褐色、較小的圓形或者近圓形至不規則形凹陷斑匯集而成，常產生的大病斑能夠擴展到果實內部。
經過實踐發病證明，彩椒發病率高于甜椒和辣椒。椒類果實伴隨著日灼病、臍腐病，在病斑上出現的黑色霉層，實際上就是混發了鏈格孢黑霉病。
椒類黑霉病病原物表現癥狀：
（1）形態：分生孢子梗單生或束生，頂端孢痕明顯，褐色。分生孢子著生在梗頂端或分枝上，褐色，兩端鈍圓，略呈卵圓形，具縱橫隔膜，隔膜處縊縮，有時隔斜生，表皮具細刺，無喙孢，大小（13.2-47.5）微米×（10.6-24.6）微米。枯葉格孢腔菌子囊座近球形，黑色，直徑250-450微米；子囊圓筒形，大小（90-160）微米×（24-40）微米子囊孢子多胞，橢圓形，具縱隔0-7格，橫隔3-7個，黃褐色，大小（31-39）微米×（13.5-18）微米。
（2）特性：孢子萌發的適溫度為24-27℃，低于12℃不發病。
椒類黑霉病侵染循環：
病原在病殘體上越冬。開春氣溫回升后，產生分生孢子，通過風雨傳播，侵入寄主，并產生大量分生孢子進行再侵染。多在果實近成熟或成熟期發生。
椒類黑霉病發生因素：
溫暖潮濕適宜病害發生。連陰雨天、植株長勢弱、田間管理粗放等是誘發本病的條件。
椒類黑霉病防治方法：防治椒類黑霉病主要通過葉面噴霧的方式防治，同時注意排濕。主要用的藥劑有：代森鋅、甲基硫菌靈、嘧菌酯、苯醚甲環唑等成分。