腐植酸肥料，經過時間的檢驗，是對環境影響力小的肥料。長期以來，泥炭及風化煤腐植酸一直是微生物菌肥中的主要充填物。究其原因就是腐植酸是微生物菌發揮作用的助劑。
微生物肥料的功能主要有：一是分解作用：分解土壤中的蛋白質、纖維素、脂肪、果膠、半纖維素、幾丁質等有機物質，增加土壤腐植質，改良土壤；二是固氮作用：固定空氣中的氮素；三是溶磷作用：溶解土壤中難溶的Ca-P、Fe-P、Al-P、Organic-P等；四是解鉀作用：北方土壤中含鉀礦物十分豐富，但礦物態鉀植物不能吸收利用，鉀細菌則能緩慢分解這些礦物態鉀使其變為可溶態鉀。五是促生長作用：促進根系及地上部生長，及促進根系吸收養分；六是抗逆境作用：提高作物抗旱、抗瘠、抗病作用，排擠有害微生物，減少植物病害；七是解毒作用：分解土壤中的農藥殘留等。
微生物菌肥的這些作用，與腐植酸的作用十分相近。實際上腐植酸施入土壤后，腐植酸有利于土壤中固氮菌、解磷菌、解鉀菌的繁殖，影響著土壤微生物的生物生理變化，促進了土壤中有益菌的作用。所以腐植酸可大幅度提高微生物肥料的效果。
由于微生物菌劑的加入，使得腐植酸有機-無機復混肥活化土壤微生物、提高氮磷鉀養分利用率的作用加強了。
試驗證明，合理施用生物腐植酸有機-無機復混肥一方面可以增加土壤有機質含量和促進多種微生物活動，改善土壤物理、化學和生物學性狀，提高土壤肥力；另一方面能夠為作物提供漸進、持續、全面的養分供應，大幅度增加作物產量。
腐植酸有機-無機復混肥中腐植酸與氮、磷、鉀含量均衡，可明顯提高氮磷鉀養分的吸收率。普通化學肥料中的N、P、K養分由于淋溶或揮發等原因不容易被作物完全吸收（利用率15%-45%）。而腐植酸肥料與相同用量的化肥相比，N的土壤自然循環還原能力增加30％～40％，P的固定損失可減少45％左右，K的流失率降低30％。肥料的利用率提高相當于農田中增施了N、P、K養分，所以腐植酸有機-無機復合肥增產效果顯著。
筆者通過玉米施用優質腐植酸有機-無機復混肥的實驗證明：施用腐植酸有機-無機復混肥的處理比施用普通復混肥的增產14.8%~23%；施用腐植酸有機-無機復混肥的處理比施用普通復混肥的氮的利用率提高20.2%；磷的利用率提高25.6%；鉀的利用率提高15.8%。
追根溯源，礦質腐植酸來源于數萬至數億年前的樹木、草本等綠色植物，取材天然。腐植酸大分子以富含羧基、羥基、醌基、酚基等有機官能團，又具有吸附、螯（絡）合、離子交換、氧化還原等獨特的生物化學性質，決定了其綠色、有機、環保的天然特性。
腐植酸通過膠體作用形成團粒結構，降低了土壤容重，提高了土壤保肥能力。腐植酸是多孔隙的疏松物質，其強大的螯（絡）合與吸附能力使其可以與大量元素、中量元素、微量元素多元融合，從而使化肥養分不易流失。
腐植酸胺是比較理想的氨穩定劑，腐植酸中的醌基具有脲酶抑制劑功能，能夠抑制土壤脲酶和硝化細菌活性，有效地控制了氮素分解和釋放的速度。
總之，腐植酸在化學肥料與土壤環境之間駕起了一座橋梁：起到了“減壓器”、“儲碳庫”和“調控閥”等作用。面對目前化學肥料對土壤環境的壓力，擴大腐植酸有機-無機肥料，較大幅度減少化肥的用量，則非常符合我國目前土壤環境的需求，是我國在肥料方面維持農業生產可持續發展的有效途徑。