有機肥中不僅含有植物必需的大量元素、微量元素，還含有豐富的有機養分，有機肥是全面的肥料，是目前市場上很受歡迎的一種肥料。自制有機肥，怎么才能發酵成功？
傳統糞便堆漚的缺點與問題
1.堆漚時間長，一般需要4~6個月，氣溫低時時間更長，而且堆漚發酵效果差。
2.長期堆置既占場地，又對周圍環境造成污染。
3.自然堆漚發酵的糞便呈爛濕狀、惡臭，難以運輸，也很難直接施用。
4.自然堆漚發酵不能很好地糞便里的病原菌、蟲卵等有害物質。
5.常用的雞糞堆肥可能含有大量，不適合做有機肥。如施用雞糞，要確保雞沒有注射。
益生菌發酵有機肥的操作技術
益生菌含有大量的功能性菌群（光合細菌、乳酸菌、酵母菌等多種復合菌群）及其代謝產物，具有加速分解轉化糞便物質的作用，能夠提高發酵轉化率，縮短發酵時間，提高發酵效果，減輕環境污染。
1.制備益生菌激活液。按照益生菌原液：營養劑：水為2:2:16的比例，配制20公斤益生菌激活液。具體配制為：先用少量熱水將2公斤營養劑溶化，然后加涼水將溫度降至30℃~35℃，倒入益生菌原液2公斤，加足水量攪勻。
2.制備“混合稀釋液”.將上一步得到的20公斤益生菌激活液倒入100~150公斤水中，注意水溫不得超過30℃以上。
3.堆放。將1噸糞便原料與秸稈等配料及腐殖質混勻，直接在地面堆制，一般堆成梯形，高不超過1.5米，堆底寬不超過5米，噴灑益生菌“混合稀釋液”，攪拌均勻，控制含水量在40%~50%，進行幾天好氧發酵至料溫達到40℃~50℃時（一般夏季1~2天，春秋季3~5天），堆垛壓實，用塑料布或防雨布密封（周圍要壓實防漏氣）進行厭氧發酵。（農報）
畜禽糞便制肥 如何降解
大部分畜禽糞便不經過堆肥處理直接施于農作物，抗性基因就會通過土壤環境進入農產品，甚至通過食物鏈進入人體，威脅人類的健康。
堆肥為處理各種廢棄物使之化和資源化的一種有效途徑，利用堆肥去除畜禽糞便中的有害污染物也能起到一定作用。通過在堆肥過程中添加抑制劑或者嗜熱菌劑等改善堆肥條件，便可以在一定程度上防止抗性基因進入土壤環境，降低抗性基因這種新型環境污染物的含量。
在實際堆肥生產中，一般會選擇添加調理劑來調節堆肥效果，通過加入嗜熱菌劑等微生物菌劑可顯著提高堆體溫度，延長高溫持續的時間。堆肥可以明顯降低糞便中濃度。