生物有機肥科技含量較高，對土壤改善、促進作物生長、抗病害等均有明顯效果。正因其的優勢和需要先進的科技支持導致市場混亂，出現一些劣質、假冒產品，讓人難以識別。南京農業大學的多位教授和學員通過長期試驗總結出“兩看一試驗”的方法教你辨別優劣生物肥。
一看包裝，是否規范
1、產品登記證：正規產品具有農業部微生物肥料登記證證號（注：省級部門無登記權），正確方法：“微生物肥（登記年）臨字（編號）號”或“微生物肥（登記年）準字（編號）號”；
2、產品技術指標：有效活菌數（CFU）≥0.2億/克，登記時農業部只允許標注≥0.2個億/克、0.5個億/克（嚴格規定，在保存期的一天必須要達到這個數值）。一些企業為了迎合市場，刻意標成幾個或幾十個億，這是不科學的（目前的技術很難達到）、是錯誤的。
3、產品有效期：國家規定大于6個月。隨著生物有機肥產品的保存時間延長，有效活菌數會不斷下降，把有效期標注太長都是不負責任的。
二看物料，是否均勻
1、產品含水量太高或太低均不利于菌種存活，判斷方法：抓一把肥料在陽光下觀察，陰潮呈團、干燥呈灰都非正常產品。
2、適合特殊功能菌種生長的“有機肥營養”應是套餐型，由多種有機營養物質組成（如：菜粕、黃豆粉等發酵制成），在光線下能看到原料的痕跡，或者能聞到原料的特殊氣味。
一試驗，效果是否明顯
試驗方法：加少量水將生物有機肥調成團狀，放在冰箱里凍成冰塊，第二天拿出來溶化，反復三次，肥料中的菌種將會凍死或大幅度減少；這是用它和將原產品進行比較試驗、在相同的田塊里觀察差異，差異明顯好肥料，差異不明顯，表明該產品有問題，建議放棄使用。