我們現在大多數人給農作物施用的肥料都是化學型肥料，如果土地上長期使用化學肥料對農作物的生長來說，應該是不利的，所以現在微生物肥料越來越廣泛的應用正說明了這一點。
微生物肥料的種類及特性微生物肥料的主要種類有根瘤菌肥料、固氮菌肥料、磷細菌肥料、硅酸鹽細菌肥料、復合微生物肥料。微生物肥料是活的生物體，有它自身的特點，合格的微生物肥料對環境污染少、用量小。其肥料的質量人眼不能判定，只能通過分析測定；肥料的作用大小易受光照、溫度、水分、酸堿度等影響。長期以來，社會上對微生物肥料的看法存在一些誤解和偏見。一種認為它肥效很大，屬肥料，甚至揚言可以完全取代化肥；另一種看法則認為它根本不是肥料。這兩種說法都不合適，合理使用微生物肥料對農作物有增產效果，但不能單施微生物肥料，一定要與化肥和有機肥配合施用，既能增產，又減少了化肥成本，還能改善土壤作物品質，保護生態環境。