近年來，黃花菜發生病蟲害的幾率越來越小了，其中重要的原因就是，隨著科學的不斷進步，農藥的研發也跟著不斷更新，所以我們防控起來黃花菜病蟲害才會慢慢的省心。不過這時候我們據對不可以掉以輕心，而是要刻不容緩的繼續加強我們的防控工作。
1、主要病害：
根腐病：開春是黃花菜根腐病的高發期，表現為返青晚，葉片細小，根莖發黑，肉質腐爛，初發時點片發生，有明顯的發病中心。輕時不抽苔，重時整穴死亡。
黃葉病：多為生理性病害，表現為葉片黃化失綠，生長發育緩慢。發病原因是多方面的，施肥不當，澆水過多，土壤板結，耕作不當，傷根嚴重，地下害蟲為害，缺素等。
葉斑病：主要為害葉片和莖苔，發病初期在嫩葉中部沿葉脈附近出現暗綠色針尖大小點，以后成為黃色斑點，邊緣呈水漬狀、半透明狀，病斑縱間比橫間擴展快，病斑發生在葉尖上則葉尖枯死；花莖苔受害嚴重時，萎縮枯死。有明顯的發病中心，嚴重時大片葉片干枯，像火燒一樣，多發生在春夏之交的多雨年份，高濕低溫情況下發病嚴重。
銹病：黃花菜銹病與小麥的葉銹病癥狀相似，是由真菌引起的病害。黃花菜銹病是近幾年關中地區流行廣、危害重的病害，前幾年多發生在花蕾末期，主要影響黃花菜的秋季生長，宿根的養分積累，近年來發病期連年提前，初蕾期就出現銹病流行。病害初期葉片及莖苔上產生鐵銹色泡狀斑點，以后散發黃褐色粉末狀孢子，孢子堆排列沒有規則，孢子堆周圍的葉片往往失綠而呈現淡黃色圈。孢子堆多時，整個葉片都變成黃色。有明顯的發病中心，先是點片發生，逐步擴散全田。
2、主要蟲害：
薊馬：成蟲體徽小，深褐色，翅兩對，狹長透明，若蟲淡灰色。成蟲和若蟲多集中在葉背面或花苔的舌葉夾縫中，危害葉片、舌葉及嫩苔，影響莖苔和花蕾的正常生長。
黃花蚜蟲：系無翅胎生蚜蟲，體長3－5cm，全身粉白色，卵有小米粒大，幼蟲體綠色，有足3對，分泌物能引誘螞蟻，能孤雌生殖，繁殖速度快。黃花蚜蟲先是群集于葉背，后又蔓延到花苔、花蕾上，嚴重時花蕾全部被蟲體覆蓋成白色，宛如蠟燭一般。蚜蟲主要吸食花蕾上的汁液，使花蕾發育不良和脫落，影響產量和質量。
地下害蟲：黃花菜的根部易遭受蠐螬為害，春季隨地溫上升，蠐螬咬食花肉質根，影響根的吸收功能。
3、病蟲害防治：
基腐病的防治：一是繁殖時不能用有疾病田塊的根苗，施用機肥時，不能用黃花菜葉漚制的堆肥。二是在發病中心周圍挖深寬各30cm的環形溝，生石灰和土1：3的混合土填平溝，進行封鎖防擴散。對病穴用1：1：100的波爾多液或500倍的70%甲托灌根，每穴1公斤藥液，每7天灌一次，共灌三次。
對黃葉病應對癥下藥，區別診治。要合理運用水肥，耕作方法要適當，特別是生長發育高峰期，施肥中耕等，農田作業應避免免傷根，對于因缺素引起的黃葉病要增加追肥和葉面噴肥，追肥用氮肥、利寶多、磷鉀肥或多元復肥為主。噴施天豐素、利寶多、磷酸二氫鉀、鐵肥等。地下害蟲為害時，灌水前畝撒施1公斤3%的呋喃丹，蟲口密度大時用5%的200倍辛硫磷藥液灌根，每穴0.5公斤。
黃花菜抽苔前，進行一次全面的病蟲害檢查和防治，噴灑500倍代森錳鋅、3000倍吡蟲啉或啶蟲咪和有關營養液混合，達到防病治蟲、增加營養的效果。
黃花菜現蕾后要注意銹病的發生，發現一點治一片，發現一片治全田。點片發生時，噴700倍代森錳鋅與1000倍25%粉銹寧混合水溶液，實行防治結合，間隔7－10天再噴一次，銹病流行時，必須連續噴藥防治三次以上。[火爆農化招商網：李旭東]