這些年來，我國大棚蔬菜的發展速度十分迅速，其栽培面積大幅度擴大，但是由于大棚的環境與露天有所不同，所以其病蟲害的發生那個也較為頻繁，想要保障生產出優質安全的蔬菜，科學正確的防治大棚蔬菜病蟲害就尤為關鍵。
由于大棚蔬菜所生長的環境中，其日光、溫度、濕度、等各方面條件都是其它種植環境與眾不同，而對應的其病蟲害的發生條件和生存條件同樣有所改變，所以對大棚蔬菜病蟲害的防治要做到一下幾個方面：
首先要正確選藥，輪換用藥。因為每種農藥都有其特定的防治對象和防治范圍，所以在用藥前要充分了解大棚蔬菜病蟲害的發生情況和環境條件，正確選擇其對應的農藥，又因為單一用藥會促使其產生抗性，所以要盡可能的選用作用機制不同的農藥進行輪換用藥。
比如殺蟲劑的有機磷制劑、擬除蟲菊酯類制劑、氨基甲酸酯制劑、有機氮制劑、生物制劑、昆蟲生長調節劑、除草劑等其作用機制各有不同。如果菜蚜對樂果產生抗藥性，就不能在使用敵敵畏，因為菜蚜也會對敵敵畏產生抗藥性，但可以選用吡蟲啉類。蔬菜一產生抗性的苯并咪唑類殺菌劑（多菌靈、托布津等）、抗生素類殺菌劑等內吸殺菌劑，可以同不一產生抗性的代森類、無機硫制劑類、銅制劑類等接觸性殺菌劑輪換使用。
其次，適時用藥。由于大棚內環境條件的會影響到藥效，所以要在合適的時期用藥，不能再高溫下使用硫制劑防治瓜類及蔬菜病害；而在冬季利用煙霧劑防治大棚蔬菜病蟲害，利用農藥氣化后冷凝成煙霧顆粒或直接把農藥分散成姻霧粒防治病蟲害，有著不錯的效果。